Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTK7Q13308 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTK7Q13308 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTK7Q13308 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTK7Q13308 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTK7Q13308 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTK7Q13308 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTK7Q13308 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTK7Q13308 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTK7Q13308 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTK7Q13308 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms