Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ECH1Q13011 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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