Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB40BQ12829 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB40BQ12829 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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RAB40BQ12829 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB40BQ12829 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB40BQ12829 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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RAB40BQ12829 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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RAB40BQ12829 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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RAB40BQ12829 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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RAB40BQ12829 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB40BQ12829 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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