Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K2

KLHL30, Kelch-like protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL30Q0D2K2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL30Q0D2K2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL30Q0D2K2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL30Q0D2K2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL30Q0D2K2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL30Q0D2K2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL30Q0D2K2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL30Q0D2K2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL30Q0D2K2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL30Q0D2K2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL30Q0D2K2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL30Q0D2K2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL30Q0D2K2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL30Q0D2K2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL30Q0D2K2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL30Q0D2K2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL30Q0D2K2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms