Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX4Q06945 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX4Q06945 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX4Q06945 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX4Q06945 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX4Q06945 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX4Q06945 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms