Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN11Q06124 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms