Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms