Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms