Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EXOSC10Q01780 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms