Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms