Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG7P83436 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG7P83436 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG7P83436 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG7P83436 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG7P83436 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG7P83436 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG7P83436 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG7P83436 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG7P83436 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG7P83436 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG7P83436 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG7P83436 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG7P83436 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COG7P83436 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG7P83436 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG7P83436 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG7P83436 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG7P83436 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG7P83436 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG7P83436 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG7P83436 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG7P83436 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COG7P83436 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG7P83436 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG7P83436 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG7P83436 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG7P83436 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG7P83436 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG7P83436 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG7P83436 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG7P83436 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG7P83436 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG7P83436 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG7P83436 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG7P83436 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG7P83436 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COG7P83436 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG7P83436 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG7P83436 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG7P83436 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG7P83436 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG7P83436 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG7P83436 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG7P83436 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG7P83436 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG7P83436 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG7P83436 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG7P83436 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG7P83436 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG7P83436 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG7P83436 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
COG7P83436 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG7P83436 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG7P83436 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG7P83436 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG7P83436 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG7P83436 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG7P83436 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG7P83436 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG7P83436 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COG7P83436 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG7P83436 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG7P83436 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG7P83436 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG7P83436 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG7P83436 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG7P83436 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG7P83436 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG7P83436 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG7P83436 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG7P83436 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG7P83436 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COG7P83436 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COG7P83436 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG7P83436 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG7P83436 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG7P83436 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG7P83436 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG7P83436 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG7P83436 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG7P83436 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG7P83436 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG7P83436 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG7P83436 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG7P83436 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COG7P83436 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG7P83436 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG7P83436 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG7P83436 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG7P83436 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG7P83436 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG7P83436 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG7P83436 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG7P83436 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG7P83436 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG7P83436 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG7P83436 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG7P83436 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG7P83436 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms