Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP2P81877 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms