Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUCB2P80303 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB2P80303 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms