Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P62891 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P62891 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P62891 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P62891 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P62891 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P62891 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P62891 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P62891 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P62891 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P62891 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P62891 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P62891 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P62891 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P62891 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P62891 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P62891 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P62891 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P62891 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P62891 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P62891 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P62891 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P62891 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL39P62891 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P62891 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P62891 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P62891 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P62891 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P62891 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P62891 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P62891 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P62891 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P62891 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P62891 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL39P62891 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P62891 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P62891 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P62891 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P62891 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P62891 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P62891 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P62891 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P62891 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P62891 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P62891 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P62891 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P62891 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P62891 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P62891 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P62891 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL39P62891 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P62891 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P62891 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P62891 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P62891 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P62891 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P62891 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P62891 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P62891 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P62891 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P62891 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P62891 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P62891 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P62891 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P62891 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P62891 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P62891 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P62891 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P62891 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL39P62891 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P62891 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P62891 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P62891 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P62891 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P62891 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P62891 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL39P62891 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms