Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL30P62888 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL30P62888 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL30P62888 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL30P62888 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL30P62888 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL30P62888 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL30P62888 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL30P62888 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL30P62888 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL30P62888 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL30P62888 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL30P62888 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL30P62888 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL30P62888 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL30P62888 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL30P62888 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL30P62888 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL30P62888 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL30P62888 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL30P62888 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL30P62888 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL30P62888 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL30P62888 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL30P62888 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL30P62888 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL30P62888 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL30P62888 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL30P62888 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL30P62888 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL30P62888 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL30P62888 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL30P62888 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL30P62888 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL30P62888 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL30P62888 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL30P62888 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL30P62888 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL30P62888 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL30P62888 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL30P62888 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL30P62888 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL30P62888 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL30P62888 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL30P62888 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL30P62888 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL30P62888 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL30P62888 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL30P62888 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL30P62888 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL30P62888 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL30P62888 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL30P62888 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL30P62888 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL30P62888 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL30P62888 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL30P62888 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL30P62888 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL30P62888 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL30P62888 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL30P62888 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL30P62888 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL30P62888 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL30P62888 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL30P62888 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL30P62888 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL30P62888 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL30P62888 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL30P62888 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL30P62888 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL30P62888 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL30P62888 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL30P62888 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL30P62888 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL30P62888 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL30P62888 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL30P62888 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL30P62888 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL30P62888 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL30P62888 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL30P62888 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL30P62888 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL30P62888 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL30P62888 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL30P62888 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL30P62888 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL30P62888 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL30P62888 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL30P62888 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL30P62888 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL30P62888 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL30P62888 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL30P62888 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL30P62888 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL30P62888 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL30P62888 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL30P62888 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL30P62888 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL30P62888 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL30P62888 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms