Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL23AP62750 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms