Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA2P62736 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms