Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCALDP61601 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCALDP61601 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCALDP61601 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCALDP61601 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCALDP61601 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCALDP61601 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCALDP61601 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCALDP61601 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCALDP61601 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCALDP61601 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCALDP61601 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCALDP61601 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCALDP61601 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCALDP61601 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCALDP61601 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCALDP61601 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCALDP61601 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCALDP61601 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCALDP61601 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCALDP61601 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NCALDP61601 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCALDP61601 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCALDP61601 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCALDP61601 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCALDP61601 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCALDP61601 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCALDP61601 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCALDP61601 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NCALDP61601 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCALDP61601 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCALDP61601 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCALDP61601 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCALDP61601 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCALDP61601 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCALDP61601 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCALDP61601 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCALDP61601 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCALDP61601 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCALDP61601 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCALDP61601 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCALDP61601 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCALDP61601 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCALDP61601 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCALDP61601 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCALDP61601 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCALDP61601 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCALDP61601 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCALDP61601 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCALDP61601 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCALDP61601 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCALDP61601 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCALDP61601 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCALDP61601 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCALDP61601 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCALDP61601 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NCALDP61601 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCALDP61601 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCALDP61601 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCALDP61601 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCALDP61601 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCALDP61601 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCALDP61601 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCALDP61601 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCALDP61601 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCALDP61601 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCALDP61601 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCALDP61601 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCALDP61601 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCALDP61601 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCALDP61601 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCALDP61601 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCALDP61601 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCALDP61601 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCALDP61601 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCALDP61601 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCALDP61601 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms