Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF3P61204 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF3P61204 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF3P61204 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF3P61204 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF3P61204 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF3P61204 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF3P61204 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF3P61204 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF3P61204 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF3P61204 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF3P61204 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF3P61204 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF3P61204 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF3P61204 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF3P61204 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF3P61204 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF3P61204 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF3P61204 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF3P61204 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF3P61204 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF3P61204 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF3P61204 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF3P61204 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARF3P61204 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ARF3P61204 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARF3P61204 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF3P61204 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF3P61204 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF3P61204 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF3P61204 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF3P61204 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF3P61204 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF3P61204 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF3P61204 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF3P61204 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF3P61204 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF3P61204 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF3P61204 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF3P61204 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF3P61204 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF3P61204 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF3P61204 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF3P61204 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF3P61204 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF3P61204 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF3P61204 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF3P61204 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF3P61204 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF3P61204 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF3P61204 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF3P61204 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARF3P61204 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARF3P61204 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF3P61204 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF3P61204 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF3P61204 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF3P61204 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF3P61204 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF3P61204 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF3P61204 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF3P61204 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF3P61204 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF3P61204 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF3P61204 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF3P61204 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF3P61204 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF3P61204 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF3P61204 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF3P61204 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF3P61204 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF3P61204 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF3P61204 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF3P61204 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF3P61204 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF3P61204 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF3P61204 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF3P61204 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF3P61204 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF3P61204 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF3P61204 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF3P61204 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF3P61204 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF3P61204 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF3P61204 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF3P61204 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF3P61204 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF3P61204 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF3P61204 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF3P61204 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF3P61204 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF3P61204 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF3P61204 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF3P61204 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF3P61204 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF3P61204 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF3P61204 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF3P61204 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF3P61204 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF3P61204 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms