Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF4A1P60842 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF4A1P60842 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms