Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTBP60709 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTBP60709 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTBP60709 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTBP60709 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTBP60709 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTBP60709 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTBP60709 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTBP60709 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTBP60709 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTBP60709 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTBP60709 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTBP60709 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTBP60709 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTBP60709 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTBP60709 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTBP60709 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTBP60709 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTBP60709 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTBP60709 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTBP60709 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTBP60709 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTBP60709 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTBP60709 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTBP60709 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTBP60709 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTBP60709 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTBP60709 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTBP60709 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTBP60709 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTBP60709 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTBP60709 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTBP60709 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTBP60709 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTBP60709 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTBP60709 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTBP60709 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTBP60709 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTBP60709 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTBP60709 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTBP60709 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTBP60709 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTBP60709 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTBP60709 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTBP60709 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTBP60709 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTBP60709 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTBP60709 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTBP60709 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTBP60709 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTBP60709 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTBP60709 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTBP60709 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTBP60709 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTBP60709 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTBP60709 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTBP60709 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTBP60709 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTBP60709 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTBP60709 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTBP60709 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTBP60709 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTBP60709 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTBP60709 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTBP60709 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTBP60709 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTBP60709 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTBP60709 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTBP60709 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTBP60709 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTBP60709 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTBP60709 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTBP60709 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTBP60709 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTBP60709 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTBP60709 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTBP60709 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTBP60709 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTBP60709 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTBP60709 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTBP60709 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTBP60709 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTBP60709 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTBP60709 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTBP60709 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTBP60709 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTBP60709 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTBP60709 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTBP60709 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTBP60709 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTBP60709 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTBP60709 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTBP60709 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTBP60709 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTBP60709 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTBP60709 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTBP60709 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTBP60709 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTBP60709 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTBP60709 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms