Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN1P60606 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms