Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME5P56597 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME5P56597 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME5P56597 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME5P56597 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME5P56597 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME5P56597 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME5P56597 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME5P56597 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME5P56597 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME5P56597 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME5P56597 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME5P56597 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME5P56597 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME5P56597 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME5P56597 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NME5P56597 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME5P56597 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME5P56597 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME5P56597 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME5P56597 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME5P56597 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME5P56597 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME5P56597 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME5P56597 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME5P56597 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME5P56597 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME5P56597 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME5P56597 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME5P56597 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME5P56597 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NME5P56597 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NME5P56597 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME5P56597 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME5P56597 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME5P56597 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME5P56597 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME5P56597 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME5P56597 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME5P56597 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME5P56597 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME5P56597 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME5P56597 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME5P56597 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME5P56597 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME5P56597 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME5P56597 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME5P56597 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME5P56597 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME5P56597 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME5P56597 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME5P56597 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME5P56597 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME5P56597 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME5P56597 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NME5P56597 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME5P56597 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME5P56597 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME5P56597 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME5P56597 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME5P56597 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME5P56597 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME5P56597 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME5P56597 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME5P56597 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME5P56597 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME5P56597 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME5P56597 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME5P56597 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME5P56597 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME5P56597 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME5P56597 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME5P56597 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME5P56597 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME5P56597 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME5P56597 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NME5P56597 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME5P56597 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME5P56597 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME5P56597 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME5P56597 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME5P56597 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME5P56597 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NME5P56597 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME5P56597 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME5P56597 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME5P56597 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME5P56597 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME5P56597 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME5P56597 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME5P56597 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NME5P56597 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME5P56597 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME5P56597 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME5P56597 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME5P56597 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME5P56597 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME5P56597 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME5P56597 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NME5P56597 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms