Protein–RNA interactions for Protein: P56557

TMEM50B, Transmembrane protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM50BP56557 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM50BP56557 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM50BP56557 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms