Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP1P56182 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP1P56182 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP1P56182 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP1P56182 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP1P56182 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP1P56182 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP1P56182 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP1P56182 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP1P56182 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP1P56182 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRP1P56182 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRP1P56182 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRP1P56182 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRP1P56182 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRP1P56182 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RRP1P56182 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRP1P56182 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRP1P56182 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP1P56182 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP1P56182 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP1P56182 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP1P56182 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP1P56182 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP1P56182 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP1P56182 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP1P56182 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP1P56182 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP1P56182 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP1P56182 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP1P56182 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP1P56182 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP1P56182 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP1P56182 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP1P56182 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRP1P56182 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRP1P56182 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RRP1P56182 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRP1P56182 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RRP1P56182 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRP1P56182 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRP1P56182 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRP1P56182 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRP1P56182 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRP1P56182 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRP1P56182 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRP1P56182 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRP1P56182 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRP1P56182 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRP1P56182 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRP1P56182 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRP1P56182 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRP1P56182 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRP1P56182 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRP1P56182 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RRP1P56182 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRP1P56182 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRP1P56182 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RRP1P56182 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RRP1P56182 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RRP1P56182 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RRP1P56182 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RRP1P56182 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RRP1P56182 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RRP1P56182 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RRP1P56182 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RRP1P56182 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RRP1P56182 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RRP1P56182 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RRP1P56182 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRP1P56182 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRP1P56182 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRP1P56182 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRP1P56182 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRP1P56182 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRP1P56182 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRP1P56182 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RRP1P56182 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RRP1P56182 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RRP1P56182 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RRP1P56182 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RRP1P56182 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRP1P56182 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRP1P56182 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRP1P56182 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RRP1P56182 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRP1P56182 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRP1P56182 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRP1P56182 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RRP1P56182 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRP1P56182 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRP1P56182 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRP1P56182 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRP1P56182 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRP1P56182 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RRP1P56182 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRP1P56182 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRP1P56182 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRP1P56182 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRP1P56182 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms