Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HADHBP55084 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HADHBP55084 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HADHBP55084 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HADHBP55084 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HADHBP55084 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HADHBP55084 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HADHBP55084 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HADHBP55084 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HADHBP55084 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HADHBP55084 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HADHBP55084 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HADHBP55084 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HADHBP55084 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HADHBP55084 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HADHBP55084 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HADHBP55084 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HADHBP55084 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HADHBP55084 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HADHBP55084 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HADHBP55084 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HADHBP55084 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HADHBP55084 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HADHBP55084 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HADHBP55084 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HADHBP55084 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HADHBP55084 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HADHBP55084 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HADHBP55084 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HADHBP55084 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HADHBP55084 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HADHBP55084 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HADHBP55084 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HADHBP55084 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HADHBP55084 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HADHBP55084 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HADHBP55084 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HADHBP55084 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HADHBP55084 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HADHBP55084 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HADHBP55084 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HADHBP55084 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HADHBP55084 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HADHBP55084 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HADHBP55084 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HADHBP55084 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HADHBP55084 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HADHBP55084 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HADHBP55084 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HADHBP55084 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HADHBP55084 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HADHBP55084 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HADHBP55084 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HADHBP55084 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHBP55084 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHBP55084 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHBP55084 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHBP55084 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHBP55084 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHBP55084 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHBP55084 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHBP55084 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHBP55084 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHBP55084 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHBP55084 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHBP55084 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHBP55084 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHBP55084 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHBP55084 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HADHBP55084 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
HADHBP55084 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HADHBP55084 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HADHBP55084 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HADHBP55084 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HADHBP55084 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HADHBP55084 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HADHBP55084 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HADHBP55084 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HADHBP55084 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HADHBP55084 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HADHBP55084 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HADHBP55084 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HADHBP55084 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HADHBP55084 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HADHBP55084 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HADHBP55084 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HADHBP55084 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HADHBP55084 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HADHBP55084 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HADHBP55084 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HADHBP55084 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HADHBP55084 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HADHBP55084 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HADHBP55084 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HADHBP55084 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HADHBP55084 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HADHBP55084 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HADHBP55084 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HADHBP55084 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HADHBP55084 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms