Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN3P54252 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms