Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOSBP53539 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOSBP53539 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOSBP53539 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOSBP53539 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOSBP53539 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOSBP53539 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOSBP53539 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOSBP53539 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOSBP53539 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FOSBP53539 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOSBP53539 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOSBP53539 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOSBP53539 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOSBP53539 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOSBP53539 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOSBP53539 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOSBP53539 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOSBP53539 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOSBP53539 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FOSBP53539 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOSBP53539 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOSBP53539 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOSBP53539 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOSBP53539 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOSBP53539 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOSBP53539 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOSBP53539 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOSBP53539 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOSBP53539 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOSBP53539 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOSBP53539 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOSBP53539 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FOSBP53539 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOSBP53539 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOSBP53539 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOSBP53539 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOSBP53539 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOSBP53539 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOSBP53539 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOSBP53539 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOSBP53539 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOSBP53539 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOSBP53539 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOSBP53539 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOSBP53539 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOSBP53539 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOSBP53539 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOSBP53539 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOSBP53539 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOSBP53539 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOSBP53539 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FOSBP53539 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOSBP53539 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOSBP53539 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOSBP53539 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOSBP53539 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOSBP53539 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOSBP53539 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOSBP53539 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOSBP53539 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOSBP53539 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOSBP53539 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOSBP53539 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOSBP53539 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOSBP53539 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOSBP53539 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOSBP53539 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOSBP53539 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOSBP53539 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOSBP53539 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOSBP53539 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOSBP53539 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOSBP53539 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOSBP53539 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOSBP53539 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOSBP53539 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOSBP53539 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FOSBP53539 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOSBP53539 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOSBP53539 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOSBP53539 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOSBP53539 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOSBP53539 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOSBP53539 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOSBP53539 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOSBP53539 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOSBP53539 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOSBP53539 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOSBP53539 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOSBP53539 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
FOSBP53539 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FOSBP53539 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOSBP53539 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOSBP53539 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOSBP53539 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOSBP53539 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOSBP53539 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOSBP53539 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOSBP53539 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms