Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP98P52948 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP98P52948 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP98P52948 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP98P52948 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP98P52948 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP98P52948 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP98P52948 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP98P52948 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP98P52948 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP98P52948 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP98P52948 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP98P52948 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP98P52948 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP98P52948 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP98P52948 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP98P52948 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP98P52948 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP98P52948 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP98P52948 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP98P52948 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NUP98P52948 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP98P52948 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP98P52948 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP98P52948 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP98P52948 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP98P52948 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP98P52948 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP98P52948 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP98P52948 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP98P52948 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP98P52948 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP98P52948 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP98P52948 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NUP98P52948 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NUP98P52948 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP98P52948 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP98P52948 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP98P52948 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP98P52948 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP98P52948 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP98P52948 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP98P52948 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP98P52948 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP98P52948 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP98P52948 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP98P52948 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP98P52948 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP98P52948 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP98P52948 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP98P52948 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP98P52948 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP98P52948 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP98P52948 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP98P52948 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP98P52948 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP98P52948 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP98P52948 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP98P52948 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP98P52948 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP98P52948 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP98P52948 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP98P52948 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP98P52948 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP98P52948 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP98P52948 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP98P52948 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP98P52948 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP98P52948 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP98P52948 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP98P52948 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP98P52948 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP98P52948 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP98P52948 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP98P52948 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP98P52948 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP98P52948 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP98P52948 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP98P52948 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP98P52948 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP98P52948 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP98P52948 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP98P52948 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NUP98P52948 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP98P52948 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP98P52948 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP98P52948 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP98P52948 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP98P52948 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP98P52948 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP98P52948 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP98P52948 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP98P52948 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP98P52948 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP98P52948 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP98P52948 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP98P52948 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP98P52948 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP98P52948 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP98P52948 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms