Protein–RNA interactions for Protein: P52735

VAV2, Guanine nucleotide exchange factor VAV2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV2P52735 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAV2P52735 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAV2P52735 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAV2P52735 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAV2P52735 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAV2P52735 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAV2P52735 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAV2P52735 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VAV2P52735 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAV2P52735 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAV2P52735 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAV2P52735 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAV2P52735 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAV2P52735 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAV2P52735 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAV2P52735 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAV2P52735 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAV2P52735 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAV2P52735 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAV2P52735 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAV2P52735 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAV2P52735 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAV2P52735 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAV2P52735 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAV2P52735 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAV2P52735 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAV2P52735 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAV2P52735 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAV2P52735 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAV2P52735 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAV2P52735 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAV2P52735 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAV2P52735 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAV2P52735 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAV2P52735 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAV2P52735 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAV2P52735 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAV2P52735 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAV2P52735 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAV2P52735 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAV2P52735 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAV2P52735 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAV2P52735 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAV2P52735 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAV2P52735 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAV2P52735 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAV2P52735 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAV2P52735 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAV2P52735 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAV2P52735 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAV2P52735 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAV2P52735 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAV2P52735 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAV2P52735 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAV2P52735 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAV2P52735 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VAV2P52735 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAV2P52735 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAV2P52735 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAV2P52735 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAV2P52735 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAV2P52735 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAV2P52735 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAV2P52735 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAV2P52735 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VAV2P52735 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAV2P52735 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAV2P52735 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAV2P52735 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAV2P52735 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAV2P52735 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAV2P52735 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAV2P52735 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAV2P52735 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAV2P52735 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAV2P52735 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAV2P52735 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAV2P52735 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAV2P52735 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAV2P52735 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAV2P52735 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAV2P52735 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAV2P52735 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAV2P52735 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAV2P52735 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAV2P52735 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAV2P52735 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAV2P52735 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAV2P52735 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAV2P52735 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAV2P52735 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAV2P52735 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VAV2P52735 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAV2P52735 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAV2P52735 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAV2P52735 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAV2P52735 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAV2P52735 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAV2P52735 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAV2P52735 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms