Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LUMP51884 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LUMP51884 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LUMP51884 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LUMP51884 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LUMP51884 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LUMP51884 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LUMP51884 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LUMP51884 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LUMP51884 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LUMP51884 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LUMP51884 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LUMP51884 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LUMP51884 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LUMP51884 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LUMP51884 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LUMP51884 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LUMP51884 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LUMP51884 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LUMP51884 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LUMP51884 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LUMP51884 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LUMP51884 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LUMP51884 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LUMP51884 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LUMP51884 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LUMP51884 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LUMP51884 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LUMP51884 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LUMP51884 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LUMP51884 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LUMP51884 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LUMP51884 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LUMP51884 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LUMP51884 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LUMP51884 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LUMP51884 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LUMP51884 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LUMP51884 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LUMP51884 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LUMP51884 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LUMP51884 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LUMP51884 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LUMP51884 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LUMP51884 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LUMP51884 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LUMP51884 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LUMP51884 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LUMP51884 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LUMP51884 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LUMP51884 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LUMP51884 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LUMP51884 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LUMP51884 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LUMP51884 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LUMP51884 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LUMP51884 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LUMP51884 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LUMP51884 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LUMP51884 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LUMP51884 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LUMP51884 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LUMP51884 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LUMP51884 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LUMP51884 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LUMP51884 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LUMP51884 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LUMP51884 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LUMP51884 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LUMP51884 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LUMP51884 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LUMP51884 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LUMP51884 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LUMP51884 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LUMP51884 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LUMP51884 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LUMP51884 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LUMP51884 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LUMP51884 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LUMP51884 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LUMP51884 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LUMP51884 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LUMP51884 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LUMP51884 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LUMP51884 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LUMP51884 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LUMP51884 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LUMP51884 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LUMP51884 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LUMP51884 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LUMP51884 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LUMP51884 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LUMP51884 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LUMP51884 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LUMP51884 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LUMP51884 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LUMP51884 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LUMP51884 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LUMP51884 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LUMP51884 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms