Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB28P51157 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB28P51157 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB28P51157 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB28P51157 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB28P51157 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB28P51157 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB28P51157 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB28P51157 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB28P51157 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB28P51157 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB28P51157 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB28P51157 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB28P51157 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB28P51157 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB28P51157 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB28P51157 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB28P51157 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB28P51157 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB28P51157 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB28P51157 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB28P51157 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB28P51157 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB28P51157 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB28P51157 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB28P51157 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB28P51157 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB28P51157 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB28P51157 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB28P51157 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB28P51157 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB28P51157 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB28P51157 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB28P51157 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB28P51157 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB28P51157 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB28P51157 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB28P51157 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB28P51157 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB28P51157 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB28P51157 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB28P51157 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB28P51157 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB28P51157 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB28P51157 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB28P51157 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB28P51157 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB28P51157 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB28P51157 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB28P51157 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB28P51157 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB28P51157 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB28P51157 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB28P51157 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB28P51157 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB28P51157 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB28P51157 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB28P51157 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB28P51157 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB28P51157 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB28P51157 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB28P51157 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB28P51157 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB28P51157 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB28P51157 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB28P51157 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB28P51157 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB28P51157 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB28P51157 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB28P51157 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB28P51157 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB28P51157 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB28P51157 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB28P51157 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB28P51157 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB28P51157 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB28P51157 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB28P51157 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB28P51157 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB28P51157 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB28P51157 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB28P51157 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB28P51157 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB28P51157 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB28P51157 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB28P51157 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB28P51157 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB28P51157 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB28P51157 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB28P51157 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB28P51157 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB28P51157 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB28P51157 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB28P51157 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB28P51157 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB28P51157 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB28P51157 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB28P51157 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB28P51157 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB28P51157 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms