Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX5P50542 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX5P50542 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX5P50542 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX5P50542 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX5P50542 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX5P50542 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX5P50542 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX5P50542 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX5P50542 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX5P50542 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX5P50542 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX5P50542 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX5P50542 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX5P50542 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX5P50542 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX5P50542 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX5P50542 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX5P50542 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX5P50542 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX5P50542 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX5P50542 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX5P50542 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX5P50542 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX5P50542 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX5P50542 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX5P50542 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX5P50542 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX5P50542 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX5P50542 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX5P50542 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX5P50542 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX5P50542 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX5P50542 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX5P50542 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX5P50542 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX5P50542 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX5P50542 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX5P50542 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX5P50542 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX5P50542 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX5P50542 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX5P50542 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX5P50542 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX5P50542 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX5P50542 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX5P50542 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX5P50542 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX5P50542 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX5P50542 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX5P50542 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX5P50542 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX5P50542 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX5P50542 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX5P50542 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX5P50542 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX5P50542 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX5P50542 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX5P50542 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX5P50542 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX5P50542 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX5P50542 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX5P50542 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX5P50542 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX5P50542 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX5P50542 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX5P50542 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX5P50542 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX5P50542 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX5P50542 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX5P50542 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX5P50542 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX5P50542 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX5P50542 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX5P50542 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX5P50542 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX5P50542 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX5P50542 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX5P50542 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX5P50542 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX5P50542 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX5P50542 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX5P50542 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX5P50542 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX5P50542 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX5P50542 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX5P50542 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX5P50542 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX5P50542 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX5P50542 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX5P50542 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX5P50542 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX5P50542 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX5P50542 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX5P50542 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX5P50542 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PEX5P50542 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PEX5P50542 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PEX5P50542 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PEX5P50542 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms