Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms