Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLK1P49759 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLK1P49759 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLK1P49759 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLK1P49759 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLK1P49759 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLK1P49759 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CLK1P49759 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLK1P49759 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLK1P49759 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLK1P49759 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLK1P49759 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLK1P49759 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLK1P49759 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLK1P49759 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CLK1P49759 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLK1P49759 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLK1P49759 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLK1P49759 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLK1P49759 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLK1P49759 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLK1P49759 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLK1P49759 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLK1P49759 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLK1P49759 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLK1P49759 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLK1P49759 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CLK1P49759 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CLK1P49759 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CLK1P49759 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CLK1P49759 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLK1P49759 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CLK1P49759 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CLK1P49759 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLK1P49759 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLK1P49759 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLK1P49759 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLK1P49759 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLK1P49759 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLK1P49759 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLK1P49759 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CLK1P49759 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLK1P49759 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLK1P49759 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLK1P49759 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CLK1P49759 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLK1P49759 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLK1P49759 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLK1P49759 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLK1P49759 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLK1P49759 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLK1P49759 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLK1P49759 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLK1P49759 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLK1P49759 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLK1P49759 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLK1P49759 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLK1P49759 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLK1P49759 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLK1P49759 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLK1P49759 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLK1P49759 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLK1P49759 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLK1P49759 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLK1P49759 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLK1P49759 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLK1P49759 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLK1P49759 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLK1P49759 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLK1P49759 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLK1P49759 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLK1P49759 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLK1P49759 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLK1P49759 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLK1P49759 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLK1P49759 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLK1P49759 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLK1P49759 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLK1P49759 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLK1P49759 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLK1P49759 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLK1P49759 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLK1P49759 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLK1P49759 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLK1P49759 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
CLK1P49759 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLK1P49759 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLK1P49759 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLK1P49759 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLK1P49759 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLK1P49759 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CLK1P49759 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLK1P49759 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLK1P49759 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLK1P49759 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLK1P49759 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLK1P49759 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLK1P49759 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLK1P49759 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLK1P49759 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms