Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK8P49336 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK8P49336 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK8P49336 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK8P49336 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK8P49336 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK8P49336 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK8P49336 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK8P49336 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK8P49336 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK8P49336 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK8P49336 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK8P49336 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK8P49336 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK8P49336 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK8P49336 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK8P49336 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK8P49336 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK8P49336 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK8P49336 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK8P49336 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK8P49336 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK8P49336 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK8P49336 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK8P49336 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK8P49336 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK8P49336 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK8P49336 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK8P49336 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK8P49336 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK8P49336 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK8P49336 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK8P49336 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK8P49336 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK8P49336 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK8P49336 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK8P49336 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK8P49336 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK8P49336 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK8P49336 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK8P49336 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK8P49336 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK8P49336 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK8P49336 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK8P49336 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK8P49336 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK8P49336 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK8P49336 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK8P49336 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK8P49336 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK8P49336 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK8P49336 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK8P49336 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK8P49336 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK8P49336 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK8P49336 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK8P49336 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK8P49336 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK8P49336 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK8P49336 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK8P49336 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK8P49336 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK8P49336 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK8P49336 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK8P49336 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK8P49336 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK8P49336 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK8P49336 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK8P49336 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK8P49336 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK8P49336 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK8P49336 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK8P49336 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK8P49336 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK8P49336 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK8P49336 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK8P49336 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK8P49336 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK8P49336 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK8P49336 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK8P49336 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK8P49336 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK8P49336 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK8P49336 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK8P49336 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK8P49336 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK8P49336 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK8P49336 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK8P49336 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK8P49336 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK8P49336 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK8P49336 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK8P49336 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK8P49336 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK8P49336 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK8P49336 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK8P49336 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK8P49336 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK8P49336 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK8P49336 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms