Protein–RNA interactions for Protein: P48201

ATP5G3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5G3P48201 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5G3P48201 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5G3P48201 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5G3P48201 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5G3P48201 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5G3P48201 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5G3P48201 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5G3P48201 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5G3P48201 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5G3P48201 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5G3P48201 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5G3P48201 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5G3P48201 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5G3P48201 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5G3P48201 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5G3P48201 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5G3P48201 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5G3P48201 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5G3P48201 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5G3P48201 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5G3P48201 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5G3P48201 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms