Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME1P48163 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME1P48163 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME1P48163 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME1P48163 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME1P48163 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME1P48163 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME1P48163 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME1P48163 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME1P48163 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME1P48163 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME1P48163 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ME1P48163 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME1P48163 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME1P48163 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME1P48163 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME1P48163 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME1P48163 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME1P48163 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME1P48163 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME1P48163 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME1P48163 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME1P48163 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME1P48163 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME1P48163 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME1P48163 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME1P48163 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME1P48163 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME1P48163 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME1P48163 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME1P48163 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME1P48163 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME1P48163 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME1P48163 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME1P48163 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME1P48163 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME1P48163 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME1P48163 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME1P48163 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME1P48163 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME1P48163 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME1P48163 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME1P48163 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME1P48163 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME1P48163 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME1P48163 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME1P48163 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ME1P48163 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ME1P48163 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ME1P48163 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ME1P48163 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ME1P48163 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ME1P48163 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ME1P48163 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ME1P48163 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ME1P48163 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ME1P48163 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ME1P48163 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ME1P48163 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ME1P48163 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ME1P48163 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ME1P48163 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ME1P48163 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ME1P48163 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ME1P48163 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ME1P48163 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ME1P48163 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ME1P48163 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ME1P48163 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ME1P48163 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ME1P48163 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ME1P48163 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ME1P48163 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ME1P48163 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ME1P48163 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ME1P48163 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ME1P48163 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ME1P48163 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME1P48163 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME1P48163 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME1P48163 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME1P48163 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME1P48163 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME1P48163 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME1P48163 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME1P48163 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME1P48163 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME1P48163 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ME1P48163 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ME1P48163 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ME1P48163 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ME1P48163 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ME1P48163 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ME1P48163 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ME1P48163 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ME1P48163 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ME1P48163 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ME1P48163 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ME1P48163 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ME1P48163 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms