Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPTX2P47972 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPTX2P47972 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms