Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSN1S1P47710 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms