Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFMP43652 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFMP43652 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFMP43652 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFMP43652 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFMP43652 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFMP43652 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFMP43652 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
AFMP43652 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFMP43652 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFMP43652 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFMP43652 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFMP43652 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFMP43652 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFMP43652 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFMP43652 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFMP43652 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFMP43652 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFMP43652 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFMP43652 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFMP43652 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFMP43652 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFMP43652 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFMP43652 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFMP43652 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFMP43652 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFMP43652 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFMP43652 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFMP43652 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AFMP43652 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFMP43652 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFMP43652 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFMP43652 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFMP43652 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFMP43652 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFMP43652 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFMP43652 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFMP43652 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFMP43652 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFMP43652 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFMP43652 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
AFMP43652 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFMP43652 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFMP43652 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFMP43652 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFMP43652 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFMP43652 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFMP43652 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFMP43652 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFMP43652 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFMP43652 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFMP43652 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFMP43652 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFMP43652 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFMP43652 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFMP43652 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFMP43652 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFMP43652 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFMP43652 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFMP43652 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFMP43652 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFMP43652 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFMP43652 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFMP43652 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFMP43652 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFMP43652 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFMP43652 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFMP43652 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFMP43652 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFMP43652 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFMP43652 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFMP43652 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFMP43652 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFMP43652 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFMP43652 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFMP43652 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFMP43652 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFMP43652 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFMP43652 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFMP43652 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFMP43652 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFMP43652 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFMP43652 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFMP43652 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFMP43652 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFMP43652 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFMP43652 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFMP43652 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFMP43652 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFMP43652 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AFMP43652 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFMP43652 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFMP43652 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFMP43652 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFMP43652 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFMP43652 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFMP43652 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFMP43652 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFMP43652 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFMP43652 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms