Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRATP43155 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRATP43155 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRATP43155 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRATP43155 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRATP43155 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRATP43155 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRATP43155 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRATP43155 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRATP43155 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRATP43155 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRATP43155 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CRATP43155 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRATP43155 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CRATP43155 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CRATP43155 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRATP43155 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRATP43155 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRATP43155 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRATP43155 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRATP43155 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRATP43155 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRATP43155 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRATP43155 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRATP43155 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRATP43155 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CRATP43155 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRATP43155 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRATP43155 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRATP43155 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRATP43155 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRATP43155 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRATP43155 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRATP43155 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CRATP43155 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRATP43155 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRATP43155 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRATP43155 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRATP43155 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRATP43155 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRATP43155 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRATP43155 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CRATP43155 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRATP43155 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRATP43155 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRATP43155 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CRATP43155 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRATP43155 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CRATP43155 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRATP43155 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRATP43155 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRATP43155 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRATP43155 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRATP43155 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRATP43155 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRATP43155 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRATP43155 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRATP43155 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRATP43155 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRATP43155 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRATP43155 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRATP43155 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRATP43155 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRATP43155 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRATP43155 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRATP43155 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CRATP43155 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRATP43155 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRATP43155 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRATP43155 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRATP43155 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRATP43155 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRATP43155 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRATP43155 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRATP43155 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRATP43155 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRATP43155 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRATP43155 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRATP43155 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRATP43155 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRATP43155 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRATP43155 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRATP43155 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRATP43155 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRATP43155 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRATP43155 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRATP43155 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRATP43155 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRATP43155 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRATP43155 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRATP43155 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRATP43155 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRATP43155 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRATP43155 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRATP43155 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRATP43155 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRATP43155 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRATP43155 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRATP43155 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRATP43155 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms