Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PTGER2P43116 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTGER2P43116 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTGER2P43116 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTGER2P43116 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTGER2P43116 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTGER2P43116 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTGER2P43116 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTGER2P43116 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTGER2P43116 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTGER2P43116 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms