Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGFRP43088 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms