Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms