Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms