Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPHP41219 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPHP41219 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPHP41219 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPHP41219 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPHP41219 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPHP41219 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPHP41219 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPHP41219 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPHP41219 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPHP41219 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPHP41219 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPHP41219 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPHP41219 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPHP41219 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPHP41219 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPHP41219 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPHP41219 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPHP41219 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPHP41219 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPHP41219 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPHP41219 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPHP41219 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPHP41219 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPHP41219 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPHP41219 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPHP41219 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPHP41219 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPHP41219 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPHP41219 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPHP41219 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPHP41219 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPHP41219 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPHP41219 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPHP41219 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPHP41219 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPHP41219 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPHP41219 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPHP41219 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPHP41219 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPHP41219 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPHP41219 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPHP41219 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPHP41219 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPHP41219 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPHP41219 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPHP41219 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPHP41219 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPHP41219 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPHP41219 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPHP41219 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPHP41219 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPHP41219 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPHP41219 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPHP41219 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPHP41219 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPHP41219 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPHP41219 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPHP41219 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPHP41219 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPHP41219 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPHP41219 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPHP41219 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPHP41219 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPHP41219 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPHP41219 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPHP41219 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPHP41219 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPHP41219 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPHP41219 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPHP41219 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPHP41219 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPHP41219 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPHP41219 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPHP41219 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPHP41219 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPHP41219 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPHP41219 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPHP41219 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPHP41219 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPHP41219 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPHP41219 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPHP41219 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPHP41219 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPHP41219 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPHP41219 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPHP41219 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPHP41219 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPHP41219 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPHP41219 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPHP41219 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPHP41219 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPHP41219 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPHP41219 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPHP41219 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPHP41219 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPHP41219 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPHP41219 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPHP41219 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPHP41219 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms