Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTRLP40313 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTRLP40313 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTRLP40313 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTRLP40313 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTRLP40313 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTRLP40313 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTRLP40313 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTRLP40313 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTRLP40313 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTRLP40313 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTRLP40313 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTRLP40313 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTRLP40313 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTRLP40313 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTRLP40313 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTRLP40313 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTRLP40313 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTRLP40313 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTRLP40313 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTRLP40313 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTRLP40313 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTRLP40313 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTRLP40313 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTRLP40313 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTRLP40313 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTRLP40313 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTRLP40313 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTRLP40313 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTRLP40313 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTRLP40313 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTRLP40313 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTRLP40313 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTRLP40313 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTRLP40313 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTRLP40313 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTRLP40313 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTRLP40313 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTRLP40313 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTRLP40313 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTRLP40313 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTRLP40313 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTRLP40313 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTRLP40313 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTRLP40313 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTRLP40313 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTRLP40313 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTRLP40313 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTRLP40313 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTRLP40313 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTRLP40313 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTRLP40313 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTRLP40313 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTRLP40313 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTRLP40313 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTRLP40313 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTRLP40313 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTRLP40313 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTRLP40313 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTRLP40313 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTRLP40313 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTRLP40313 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTRLP40313 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTRLP40313 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTRLP40313 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTRLP40313 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTRLP40313 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTRLP40313 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTRLP40313 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTRLP40313 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTRLP40313 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTRLP40313 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTRLP40313 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTRLP40313 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTRLP40313 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTRLP40313 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTRLP40313 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTRLP40313 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTRLP40313 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTRLP40313 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTRLP40313 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTRLP40313 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTRLP40313 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTRLP40313 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTRLP40313 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTRLP40313 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTRLP40313 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTRLP40313 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTRLP40313 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTRLP40313 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTRLP40313 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTRLP40313 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTRLP40313 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTRLP40313 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTRLP40313 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTRLP40313 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTRLP40313 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTRLP40313 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTRLP40313 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTRLP40313 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms