Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETFBP38117 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETFBP38117 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETFBP38117 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ETFBP38117 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETFBP38117 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETFBP38117 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETFBP38117 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETFBP38117 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETFBP38117 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETFBP38117 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETFBP38117 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETFBP38117 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETFBP38117 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETFBP38117 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETFBP38117 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETFBP38117 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ETFBP38117 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETFBP38117 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETFBP38117 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETFBP38117 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETFBP38117 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETFBP38117 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETFBP38117 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETFBP38117 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETFBP38117 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETFBP38117 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETFBP38117 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETFBP38117 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ETFBP38117 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ETFBP38117 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ETFBP38117 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ETFBP38117 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ETFBP38117 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ETFBP38117 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ETFBP38117 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ETFBP38117 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ETFBP38117 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ETFBP38117 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ETFBP38117 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ETFBP38117 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ETFBP38117 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETFBP38117 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETFBP38117 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETFBP38117 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETFBP38117 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ETFBP38117 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETFBP38117 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETFBP38117 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETFBP38117 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETFBP38117 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETFBP38117 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETFBP38117 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETFBP38117 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETFBP38117 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETFBP38117 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETFBP38117 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETFBP38117 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETFBP38117 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETFBP38117 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETFBP38117 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ETFBP38117 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETFBP38117 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETFBP38117 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETFBP38117 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETFBP38117 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETFBP38117 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETFBP38117 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETFBP38117 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETFBP38117 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETFBP38117 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ETFBP38117 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETFBP38117 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETFBP38117 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETFBP38117 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETFBP38117 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETFBP38117 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETFBP38117 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETFBP38117 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ETFBP38117 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETFBP38117 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ETFBP38117 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETFBP38117 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETFBP38117 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETFBP38117 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETFBP38117 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETFBP38117 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETFBP38117 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETFBP38117 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETFBP38117 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETFBP38117 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETFBP38117 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETFBP38117 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETFBP38117 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETFBP38117 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETFBP38117 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETFBP38117 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETFBP38117 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETFBP38117 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETFBP38117 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms