Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms